为了做好2022年度个人所得税综合所得汇算清缴工作，税务部门推出了预约办理服务，有汇算初期（2023年3月1日至3月20日）办理需求的纳税人，可以根据自身情况，在2月16日后通过个税APP及网站预约上述时间段中的任意一天办理。3月21日至6月30日，纳税人无需预约，可以随时办理。纳税人包括灵活就业人员可以根据自身情况，在2月16日后通过个税APP及网站预约3月1日至3月20日中的任意一天办理个人所得税综合所得汇算清缴。

灵活就业人员一般都是选择自行缴纳基本社会保险和基本医疗保险的，平时往往没有在缴纳个人所得税时扣除，那么在进行年度个人所得税综合所得汇算清缴时可以进行扣除吗？

《个人所得税法》（主席令第九号）第六条第一款第（一）项规定，居民个人的综合所得，以每一纳税年度的收入额减除费用六万元以及专项扣除、专项附加扣除和依法确定的其他扣除后的余额，为应纳税所得额。第六条第四款规定，本条第一款第一项规定的专项扣除，包括居民个人按照国家规定的范围和标准缴纳的基本养老保险、基本医疗保险、失业保险等社会保险费和住房公积金等；专项附加扣除，包括子女教育、继续教育、大病医疗、住房贷款利息或者住房租金、赡养老人等支出，具体范围、标准和实施步骤由国务院确定，并报全国人民代表大会常务委员会备案。

《财政部 国家税务总局关于基本养老保险费基本医疗保险费失业保险费 住房公积金有关个人所得税政策的通知》（财税〔2006〕10号）第一条规定，企事业单位按照国家或省（自治区、直辖市）人民政府规定的缴费比例或办法实际缴付的基本养老保险费、基本医疗保险费和失业保险费，免征个人所得税；个人按照国家或省（自治区、直辖市）人民政府规定的缴费比例或办法实际缴付的基本养老保险费、基本医疗保险费和失业保险费，允许在个人应纳税所得额中扣除。企事业单位和个人超过规定的比例和标准缴付的基本养老保险费、基本医疗保险费和失业保险费，应将超过部分并入个人当期的工资、薪金收入，计征个人所得税。

根据上述规定，灵活就业人员缴纳的社保可以作为专项扣除在计算缴纳个人所得税时扣除。